Protein–RNA interactions for Protein: Q04893

YMR317W, Uncharacterized protein YMR317W, yeast

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR317W	Q04893	snR77	snR77	88 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
YMR317W	Q04893	snR161	snR161	161 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
YMR317W	Q04893	snR75	snR75	89 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
YMR317W	Q04893	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
YMR317W	Q04893	snR33	snR33	183 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
YMR317W	Q04893	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
YMR317W	Q04893	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
YMR317W	Q04893	snR40	snR40	97 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	snR6	snR6	112 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
YMR317W	Q04893	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
YMR317W	Q04893	snR73	snR73	106 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YMR317W	Q04893	YOR309C	YOR309C	381 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YMR317W	Q04893	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YMR317W	Q04893	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YMR317W	Q04893	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YMR317W	Q04893	snR58	snR58	96 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
YMR317W	Q04893	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
YMR317W	Q04893	snR87	snR87	109 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
YMR317W	Q04893	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
YMR317W	Q04893	YDR543C	YDR543C	300 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
YMR317W	Q04893	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
YMR317W	Q04893	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
YMR317W	Q04893	YJR162C	YJR162C	351 nt		-2.49	□□□□□ -2.81

Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 3.3 ms