Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms