Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms