Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBX2P40425 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PBX2P40425 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PBX2P40425 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBX2P40425 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBX2P40425 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBX2P40425 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms