Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms