Protein–RNA interactions for Protein: P32786

RRN6, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN6, yeast

Predictions only

Length 894 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN6	P32786	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		0.06	□□□□□ -2.4
RRN6	P32786	snR161	snR161	161 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RRN6	P32786	snR40	snR40	97 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RRN6	P32786	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RRN6	P32786	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
RRN6	P32786	snR6	snR6	112 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
RRN6	P32786	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
RRN6	P32786	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
RRN6	P32786	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
RRN6	P32786	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
RRN6	P32786	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
RRN6	P32786	snR73	snR73	106 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
RRN6	P32786	snR33	snR33	183 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
RRN6	P32786	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
RRN6	P32786	YOR309C	YOR309C	381 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
RRN6	P32786	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
RRN6	P32786	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
RRN6	P32786	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
RRN6	P32786	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
RRN6	P32786	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
RRN6	P32786	snR58	snR58	96 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
RRN6	P32786	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
RRN6	P32786	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
RRN6	P32786	snR87	snR87	109 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
RRN6	P32786	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
RRN6	P32786	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
RRN6	P32786	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.32	□□□□□ -2.78
RRN6	P32786	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-2.55	□□□□□ -2.82
RRN6	P32786	YJR162C	YJR162C	351 nt		-3.3	□□□□□ -2.94

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