Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG2P13727 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms