Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtrP07309 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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TtrP07309 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtrP07309 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TtrP07309 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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