Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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