Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms