Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms