Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms