Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC010608.1-201ENST00000507964 275 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC006449.1-201ENST00000616263 571 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 GALNTL6-203ENST00000506823 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 RCAN1-203ENST00000381135 2526 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC104619.3-201ENST00000509116 1387 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 SLC6A15-211ENST00000552192 2221 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC120114.2-201ENST00000567795 2272 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 ZNF544-215ENST00000599953 2274 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 PPFIA2-211ENST00000548586 4033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRHP20396 EIF2S1-201ENST00000256383 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 BROX-207ENST00000537020 3670 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 ZFYVE26-209ENST00000557306 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 SUPT7L-204ENST00000406540 2869 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 MYOM2-201ENST00000262113 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 CLLU1OS-201ENST00000378487 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 LINC01799-201ENST00000411701 386 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 RPL29P25-201ENST00000465069 850 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 EGFLAM-AS1-201ENST00000508986 331 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 NPIPA3-201ENST00000526520 954 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 NPIPA2-202ENST00000530328 954 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 NPIPA3-202ENST00000531598 1155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 NPIPA5-202ENST00000534094 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC104046.1-201ENST00000559487 406 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC098850.2-201ENST00000578710 686 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms