Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms