Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cml5Q9QXS8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cml5Q9QXS8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms