Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms