Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xab2Q9DCD2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms