Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifi35Q9D8C4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifi35Q9D8C4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms