Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms