Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms