Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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