Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms