Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca3Q99M54 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms