Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED4Q96RK1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms