Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms