Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smap2Q7TN29 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms