Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CREB3L3Q68CJ9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms