Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP28Q4G0W2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms