Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms