Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pate4Q09098 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms