Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp10Q000W5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms