Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSCP56915 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSCP56915 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSCP56915 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSCP56915 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSCP56915 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms