Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms