Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD2P49005 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD2P49005 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD2P49005 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD2P49005 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD2P49005 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD2P49005 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD2P49005 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD2P49005 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms