Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms