Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms