Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPIFP30405 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPIFP30405 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPIFP30405 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPIFP30405 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPIFP30405 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPIFP30405 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPIFP30405 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPIFP30405 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PPIFP30405 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms