Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra3P26049 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms