Protein–RNA interactions for Protein: P22001

KCNA3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA3P22001 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA3P22001 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA3P22001 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms