Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD28P10747 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD28P10747 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD28P10747 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD28P10747 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD28P10747 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD28P10747 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms