Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cops3O88543 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms