Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB3O43889 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3O43889 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB3O43889 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB3O43889 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB3O43889 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms