Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim18J3QNP2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim18J3QNP2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim18J3QNP2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim18J3QNP2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smim18J3QNP2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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