Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms