Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3550W4VSN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3550W4VSN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3550W4VSN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3550W4VSN7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms