Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17190V9GX38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17190V9GX38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17190V9GX38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17190V9GX38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17190V9GX38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17190V9GX38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17190V9GX38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17190V9GX38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17190V9GX38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17190V9GX38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17190V9GX38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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