Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptgdr2Q9Z2J6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptgdr2Q9Z2J6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptgdr2Q9Z2J6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptgdr2Q9Z2J6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptgdr2Q9Z2J6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptgdr2Q9Z2J6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptgdr2Q9Z2J6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptgdr2Q9Z2J6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms