Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdpk1Q9Z2A0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdpk1Q9Z2A0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdpk1Q9Z2A0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms