Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S0

Bub1b, Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bub1bQ9Z1S0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bub1bQ9Z1S0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Bub1bQ9Z1S0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bub1bQ9Z1S0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bub1bQ9Z1S0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bub1bQ9Z1S0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bub1bQ9Z1S0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bub1bQ9Z1S0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bub1bQ9Z1S0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bub1bQ9Z1S0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bub1bQ9Z1S0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bub1bQ9Z1S0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bub1bQ9Z1S0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bub1bQ9Z1S0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms