Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D17h6s53eQ9Z1R4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D17h6s53eQ9Z1R4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17h6s53eQ9Z1R4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms